Salk-instituutti kartoitti 1 000 Alzheimeriin liittyvää piilotettua aivojen mikroproteiinia

Salk-instituutin tutkijat ovat koonneet ensimmäisen kartaston ihmisen aivokuoren mikroproteiineista. He luetteloivat yli 1 000 aiemmin tuntematonta pientä proteiinia ja paljastivat mahdollisen yhteyden yhden niistä ja Alzheimerin taudin immuunisolujen toimintahäiriön välillä. Syyskuun 14. päivänä Nature Aging -lehdessä julkaistu tutkimus tarjoaa tutkijoille uuden resurssin neurodegeneraation molekyylitason taustojen tutkimiseen.salk+1

Tuhat uutta proteiinia piilossa näkyvillä

Mikroproteiinit – pienempi proteiiniluokka, joka on jäänyt pitkälti huomiotta kokonsa vuoksi – näyttelevät tärkeitä mutta huonosti ymmärrettyjä rooleja terveydessä ja sairauksissa. Tutkijat Brendan Miller ja Alan Saghatelian käyttivät 480 ihmisen aivokuoren näytettä Alzheimeria sairastavista ja terveistä aivoista ja tunnistivat 1 067 luokittelematonta mikroproteiinia, joista monia ei ollut aiemmin havaittu. Tiimi hyödynsi ShortStop-työkalua, joka on Saghatelianin laboratoriossa vuonna 2025 kehitetty tekoälypohjainen sovellus, seuloakseen olemassa olevia transkriptomi- ja massaspektrometriadatoja näiden vaikeasti havaittavien molekyylien merkkien löytämiseksi.salk+1

"Emme vieläkään täysin ymmärrä terveen ikääntymisen molekyylimekanismeja, ja tämä pätee erityisesti mikroproteiineihin, jotka ovat jääneet vahingossa huomiotta vuosikymmenten ajan", Saghatelian sanoi Salk-instituutin lehdistötiedotteessa. Kartasto on julkisesti saatavilla muiden tutkijoiden ladattavaksi ja käytettäväksi.salk

Immuunisolujen toimintahäiriöön liittyvä mikroproteiini

Kartaston löydösten joukossa Salk-tiimi keskittyi mikroglioihin, aivojen omiin immuunisoluihin, jotka muuttuvat usein toimintakyvyttömiksi iän myötä ja neurodegeneratiivisissa sairauksissa. Tutkijat tuottivat omat massaspektrometriadat mikroglioista ja havaitsivat, että nämä solut tuottivat tiettyä mikroproteiinia geneettisestä koodista, joka normaalisti koodaisi erilaista, suurempaa proteiinia.salk

Kun tiimi poisti mikroproteiinista vastaavan geenin mikroglioista, solujen mitokondrioiden toiminta heikkeni – mikä viittaa siihen, että mikroproteiinilla on rooli näiden immuunisolujen toimintakyvyn ylläpitämisessä. Sadat vastalöydetyt mikroproteiinit ilmenivät eri tasoilla Alzheimerin tautia sairastavien aivosoluissa verrattuna terveisiin soluihin, ja Alzheimer-soluilla oli taipumus ilmentää enemmän mikroproteiineja yleisesti.salk

Pelikirjan laajentaminen neurodegeneraatiota vastaan

Tutkimus hyödynsi Religious Orders Study/Memory and Aging Project -kohortin näytteitä, ja sitä rahoittivat National Institutes of Health sekä Clayton Medical Research Foundation. Erillisessä mutta aiheeseen liittyvässä tutkimuksessa, joka julkaistiin myös tällä viikolla Nature Neuroscience -lehdessä, saksalaisen neurodegeneratiivisten sairauksien keskuksen tutkijat havaitsivat, että kromatiiniproteiini DAXX auttaa pitämään mikroglian toimintakykyisenä vaimentamalla normaalisti hiljaisia geneettisiä elementtejä, jotka voivat aktivoitua iän myötä aiheuttaen tulehdusta ja soluvaurioita.medicalxpress+1

"Jokaisella valmentajalla on pelikirja, ja haluat mahdollisimman monta peliä voittaaksesi ottelun", Miller sanoi. "Tutkijoille peli on yritystä ymmärtää sairautta, ja pelit ovat proteiineja ja mikroproteiineja, jotka voivat olla tai olla olematta mukana kyseisessä sairaudessa."salk