„Colossal“ pristatė DI įrankį, skirtą dodo paukščio snapo genams rasti

„Colossal Biosciences“ trečiadienį, spalio 14 d., pranešė, kad nauja dirbtinio intelekto platforma „GenoMorph“ rado apie 2 300 kandidatinių genų redagavimo taikinių, kurie gali paaiškinti didelį, užlenktą dodo snapą ir veido struktūrą. Dalase įsikūrusi įmonė planuoja redaguoti dodo bruožus į nikobarinių karvelių, artimiausių dodo giminaičių, ląsteles. Bendrovė teigia, kad dodo genomas dabar užpildytas 95%, tačiau nepateikė paukščio išsiritimo termino.ksl.com+1

Kaip veikia „GenoMorph“

Pagrindinė problema yra duomenų trūkumas. „Colossal“ turi tik vieną dodo genomą, palyginti su maždaug 100 mamutų projektui, nes tropikuose DNR suyra greičiau nei šaltame klimate. „Paprastai mokslininkai lygina daugybę genomų“, kad surastų už bruožą atsakingus genus, sakė vyriausioji mokslo darbuotoja Beth Shapiro. „Todėl „GenoMorph“ tiria, kaip kaukolės ir snapai vystosi daugiau nei 70 gyvų paukščių rūšių, ir mokosi, kurie genetiniai jungikliai kontroliuoja jų formą“.techcrunch.com+1

Platforma sujungia 3D kaukolės matavimus su duomenimis apie embrionų vystymąsi vištose, putpelėse, ančių ir balandžių rūšyse. Generalinis direktorius Benas Lammas tai pavadino „dodo genomo lobių žemėlapiu“. Analizė išskyrė 653 reguliacinius elementus, susijusius su snapo dydžiu, ir 1 698, susijusius su snapo storiu bei pločiu. „Colossal“ pažymėjo, kad šie radiniai „dar neįrodo, jog šie elementai sukelia tuos bruožus“. Straipsnis, aprašantis platformą, bus paskelbtas „bioRxiv“ išankstinių publikacijų serveryje.prnewswire.com+2

Greitesni bandymai su embrionais

„Colossal“ taip pat paskelbė apie lipidų nanodalelių sistemą, kuri genų redagavimo įrankius pristato tiesiai į besivystančius paukščių embrionus. Tai leidžia tyrėjams pamatyti redagavimo poveikį „nelaukiant viso veisimosi ciklo“, sakė Lammas. Jų nikobarinių karvelių kolonija Teksase išaugo iki 36 paukščių, o įmonė išskyrė pirmines lytines ląsteles, kurios tampa kiaušinėliais ir sperma. Taip pat pranešta apie išsiritusius vištų embrioninių kamieninių ląstelių chimeras. „Colossal“ patobulino dodo genomo surinkimą naudodama programinę įrangą, iš pradžių sukurtą jų baisiojo vilko projektui – tą pačią programą, kuri buvo naudojama pilkiesiems vilkams, kuriuos, kaip pernai teigė įmonė, jie modifikavo baisiojo vilko bruožais.ksl.com+2

Kliūtys prieš Mauricijų

Įmonė nepateikė oficialios išsiritimo datos. „Time“ pranešė, kad „Colossal“ mokslininkai prašo kantrybės dėl maždaug penkerių metų laikotarpio, kurio, jų manymu, prireiks darbui. Kritikai atkreipia dėmesį, kad rezultatas būtų „funkcionalus“ dodo: balandžio genomas su pridėtais pasirinktais dodo bruožais, o ne tiksli išnykusio paukščio kopija.time.com+1

Lammas sakė, kad „Colossal“ bendradarbiauja su Mauricijaus mokslininkais, gamtosaugos grupėmis ir Mauricijaus vyriausybe. Jis teigė, kad jokios paleidimo vietos nebus parinktos, kol nebus baigti ekologiniai darbai ir bendruomenės konsultacijos. „Didžiausios kliūtys yra įrodyti, kurie genetiniai pokyčiai iš tikrųjų svarbūs, atlikti daugybę tokių redagavimų paukštyje, perduoti juos kitai kartai ir paruošti saugius namus dodo paukščiams Mauricijuje“, – sakė jis.ksl.com