Colossal stellt KI-Tool zur Entschlüsselung von Dodo-Genen vor

Colossal Biosciences teilte am Mittwoch, den 14. Oktober, mit, dass eine neue Plattform für künstliche Intelligenz namens GenoMorph etwa 2 300 Zielkandidaten für die Genbearbeitung gefunden hat, die den großen, hakenförmigen Schnabel und die Gesichtsstruktur des Dodos erklären könnten. Das in Dallas ansässige Unternehmen plant, Dodo-Merkmale in die Zellen der Nikobartaube, des nächsten lebenden Verwandten des Dodos, einzubringen. Das Unternehmen gibt an, dass sein Dodo-Genom nun zu 95 Prozent vervollständigt sei, nannte jedoch keinen Zeitrahmen für das Schlüpfen eines Vogels.ksl.com+1

Funktionsweise von GenoMorph

Das Hauptproblem ist der Mangel an Daten. Colossal verfügt nur über ein einziges Dodo-Genom, verglichen mit etwa 100 für sein Wollhaarmammut-Projekt, da DNA in den Tropen schneller zerfällt als in kalten Klimazonen. "Normalerweise vergleichen Wissenschaftler viele Genome", um die Gene hinter einem Merkmal zu finden, sagte die wissenschaftliche Leiterin Beth Shapiro. "Stattdessen untersucht GenoMorph, wie sich Schädel und Schnäbel bei über 70 lebenden Vogelarten entwickeln, und lernt, welche genetischen Schalter deren Form steuern".techcrunch.com+1

Die Plattform kombiniert 3D-Schädelvermessungen mit Daten zur Embryonalentwicklung bei Hühnern, Wachteln, Enten und Tauben. CEO Ben Lamm nannte es eine "Schatzkarte für das Dodo-Genom". Die Analyse markierte 653 regulatorische Elemente, die mit der Schnabelgröße verbunden sind, und 1 698, die mit der Schnabeldicke und -breite zusammenhängen. Colossal merkte an, dass diese Ergebnisse "noch nicht belegen, dass die Elemente diese Merkmale verursachen". Ein Papier, das die Plattform beschreibt, wird auf dem Preprint-Server bioRxiv veröffentlicht.prnewswire.com+2

Schnellere Tests in Embryonen

Colossal kündigte zudem ein Lipid-Nanopartikel-System an, das Genbearbeitungswerkzeuge direkt in sich entwickelnde Vogelembryonen liefert. Dies ermöglicht es Forschern, die Wirkung einer Bearbeitung zu sehen, "ohne einen gesamten Brutzyklus abwarten zu müssen", so Lamm. Die Kolonie von Nikobartauben in Texas ist auf 36 Vögel angewachsen, und das Unternehmen hat primordiale Keimzellen gewonnen, die Zellen, aus denen Eier und Spermien entstehen. Zudem wurde über das Schlüpfen von Hühner-Embryonalstammzell-Chimären berichtet. Colossal verbesserte die Dodo-Genom-Assemblierung mithilfe einer Software, die ursprünglich für das Projekt mit dem ausgestorbenen Direwolf entwickelt wurde – dasselbe Programm, das auch hinter den Grauwölfen steckt, bei denen das Unternehmen letztes Jahr angab, sie mit Direwolf-Merkmalen manipuliert zu haben.ksl.com+2

Hürden vor Mauritius

Das Unternehmen nannte kein offizielles Datum für ein Schlüpfen. Time berichtete, dass die Wissenschaftler von Colossal um Geduld für die etwa fünf Jahre bitten, die die Arbeit voraussichtlich in Anspruch nehmen wird. Kritiker weisen darauf hin, dass das Ergebnis ein "funktionaler" Dodo wäre: ein Taubengenom mit hinzugefügten, ausgewählten Dodo-Merkmalen, keine exakte Kopie des ausgestorbenen Vogels.time.com+1

Lamm sagte, Colossal arbeite mit mauritischen Wissenschaftlern, Naturschutzgruppen und der Regierung von Mauritius zusammen. Er erklärte, dass keine Auswilderungsorte ausgewählt würden, bevor die ökologischen Arbeiten und die Konsultationen mit der Gemeinschaft abgeschlossen seien. "Die großen Hürden, die vor uns liegen, sind der Nachweis, welche genetischen Veränderungen wirklich wichtig sind, die Durchführung vieler dieser Bearbeitungen in einem Vogel und deren Weitergabe an die nächste Generation sowie die Vorbereitung eines sicheren Zuhauses für Dodos auf Mauritius", sagte er.ksl.com