Colossal presenta una IA para identificar los genes del pico del dodo

Colossal Biosciences anunció el miércoles 14 de octubre que una nueva plataforma de inteligencia artificial llamada GenoMorph ha encontrado cerca de 2,300 objetivos de edición genética que podrían explicar el gran pico ganchudo y la estructura facial del dodo. La empresa con sede en Dallas planea editar rasgos del dodo en células de la paloma de Nicobar, el pariente vivo más cercano del dodo. La compañía afirma que su genoma del dodo está completo en un 95%, pero no ofreció plazos para la eclosión de un ejemplar.ksl.com+1

Cómo funciona GenoMorph

El principal problema es la falta de datos. Colossal solo posee un genoma de dodo, en comparación con los cerca de 100 de su proyecto del mamut lanudo, debido a que el ADN se degrada más rápido en los trópicos que en climas fríos. "Normalmente, los científicos comparan muchos genomas" para encontrar los genes detrás de un rasgo, explicó la directora científica Beth Shapiro. "Por ello, GenoMorph estudia cómo se desarrollan los cráneos y picos en más de 70 especies de aves vivas y aprende qué interruptores genéticos controlan su forma".techcrunch.com+1

La plataforma combina mediciones de cráneos en 3D con datos sobre el desarrollo embrionario en pollos, codornices, patos y palomas. El CEO Ben Lamm lo calificó como un "mapa del tesoro para el genoma del dodo". El análisis marcó 653 elementos reguladores vinculados al tamaño del pico y 1,698 al grosor y la anchura. Colossal señaló que estos hallazgos "aún no establecen que los elementos causen esos rasgos". Un artículo que describe la plataforma se publicará en el servidor de preimpresión bioRxiv.prnewswire.com+2

Pruebas más rápidas en embriones

Colossal también anunció un sistema de nanopartículas lipídicas que introduce herramientas de edición genética directamente en embriones de aves en desarrollo. Esto permite a los investigadores observar el efecto de una edición "sin tener que esperar a completar un ciclo de reproducción", dijo Lamm. Su colonia de palomas de Nicobar en Texas ha crecido a 36 aves, y la empresa ha derivado células germinales primordiales, las células que se convierten en óvulos y espermatozoides. También informó sobre la eclosión de quimeras de células madre embrionarias de pollo. Colossal mejoró el ensamblaje del genoma del dodo utilizando software creado originalmente para su proyecto del lobo terrible, el mismo programa detrás de los lobos grises que, según dijo el año pasado, habían sido modificados con rasgos de lobo terrible.ksl.com+2

Obstáculos antes de Mauricio

La empresa no dio una fecha oficial para una eclosión. Time informó que los científicos de Colossal piden paciencia durante los aproximadamente cinco años que esperan que tome el trabajo. Los críticos señalan que el resultado sería un dodo "funcional": un genoma de paloma con rasgos seleccionados del dodo, no una copia exacta del ave extinta.time.com+1

Lamm afirmó que Colossal está trabajando con científicos mauricianos, grupos de conservación y el gobierno de Mauricio. Aseguró que no se elegirán sitios de liberación hasta que se completen el trabajo ecológico y la consulta comunitaria. "Los grandes obstáculos por delante son demostrar qué cambios genéticos realmente importan, realizar muchas de esas ediciones en un ave y transmitirlas a la siguiente generación, y preparar un hogar seguro para los dodos en Mauricio", concluyó.ksl.com