Fyrsta fullkomna fuglgenómíið leiðir í ljós þúsundir falinna söngfuglgena

Vísindamenn við Rockefeller University hafa búið til fyrstu fullkomnu genómsamsetningu sebrafinku, afhjúpað 2.710 áður óþekkt gen og skilað nákvæmasta fuglgenómíi sem til er. Afrekið, sem birt var í Cell þann 6. ágúst, brúar langvarandi eyður í erfðakorti söngfuglsins og leggur nýjan grunn að rannsóknum á líffræði hljóðnáms.rockefeller+1

Áfangi í fuglaerfðafræði

Nýja samsetningin er fyrsta fullkomlega fasaða, tvílitna telómer-til-telómer genómíið af fugli, sem þýðir að það nær yfir hvern litning frá enda til enda á meðan það greinir á milli DNA frá hvoru foreldri. Það bætir við um 90 milljónum basapara sem vantaði í fyrri útgáfur og leysir úr öllum 11 litlu punktlitningum sebrafinkunnar, mannvirkjum sem lengi höfðu reynst erfitt að raðgreina.technologynetworks+1

Verkið er hluti af samræmdum pakka 10 greina frá Telomere-to-Telomere Consortium sem birtar voru samtímis í Cell og Cell Genomics, þar sem aðferðum samsteypunnar við að ljúka genómíum er beitt á aðrar tegundir en menn.eurekalert+1

"Þetta er annað fullkomna genómíið af tegund sem lærir hljóð. Það fyrsta var mannsins," sagði Erich D. Jarvis, yfirmaður rannsóknarstofu í tauguerfðafræði tungumáls við Rockefeller. "Ef það er til lykilsameind sem breytir tegund sem ekki lærir hljóð í tegund sem gerir það, þá er hún þarna einhvers staðar."rockefeller+1

Að yfirstíga tæknilegar hindranir

Genóm fugla eru þekkt fyrir að vera erfið í samsetningu vegna þess að þau innihalda tugi örlitninga og langa kafla af endurteknu DNA sem valda því að raðgreiningartæki stöðvast. Teymið sameinaði margar raðgreiningartækni, þar á meðal aðferðir sem geta lesið óvenju langar DNA-sameindir, og þróaði sérsniðið samskiptareglur til að skola efnafræðilega og endurræsa tæki þegar endurteknar raðir stífluðu þau.bioengineer+1

Ólíkt fyrsta telómer-til-telómer genómíi mannsins, sem byggði á einlitna frumulínu, krafðist þetta verkefni þess að aðskilja rétt tvö foreldralitningasett í tvílitna lífveru, sem skiptir máli fyrir skilning á genastjórnun, næmi fyrir sjúkdómum og hegðun.bioengineer

Þráðhöft og vísbendingar um þróun

Meðal mikilvægustu niðurstaðna kortlögðu vísindamennirnir þráðhöft sebrafinkunnar og uppgötvuðu að fuglar deila mjög skipulagðri byggingu þráðhafta sem áður var talið vera einstakt fyrir spendýr. "Þráðhaftið er grundvallareining frumunnar sem gerir hverja frumuskiptingu mögulega og tryggir rétta aðgreiningu litninga," sagði Giulio Formenti, rannsóknardósent á Jarvis-rannsóknarstofunni.technologynetworks+1

Genómíið er nú verið að innlima í Vertebrate Genomes Project, sem Jarvis og Formenti stýra saman, þar sem það mun þjóna sem viðmið fyrir samanburðargreiningar yfir allt lífríki hryggdýra.rockefeller+1

"Þetta eru tímamót á sviðinu," sagði Jarvis. "Við höfum allt genómíið og vísindamenn geta nú notað það til að rannsaka líffræðina."technologynetworks