İlk tam kuş genomu binlerce gizli ötücü kuş genini ortaya çıkardı

Rockefeller Üniversitesi'ndeki araştırmacılar, zebra ispinozunun ilk tam genom dizilimini oluşturarak daha önce bilinmeyen 2.710 geni ortaya çıkardı ve bugüne kadar birleştirilmiş en doğru kuş genomunu sundu. 6 Ağustos'ta Cell dergisinde yayınlanan bu başarı, ötücü kuşların genetik haritasındaki uzun süreli boşlukları gideriyor ve vokal öğrenme biyolojisini incelemek için yeni bir temel sağlıyor.rockefeller+1

Kuş Genomiğinde Bir Dönüm Noktası

Yeni dizilim, herhangi bir kuş türünün ilk tam fazlı, diploid telomerden telomere genomu olma özelliğini taşıyor; bu da her kromozomun baştan sona yakalandığı ve her ebeveynden miras alınan DNA'nın ayırt edildiği anlamına geliyor. Çalışma, önceki versiyonlarda eksik olan yaklaşık 90 milyon baz çiftini ekledi ve zebra ispinozunun uzun süredir dizileme teknolojilerinden kaçan 11 küçük nokta kromozomunun tamamını çözümledi.technologynetworks+1

Bu çalışma, Telomere-to-Telomere Konsorsiyumu tarafından Cell ve Cell Genomics dergilerinde eş zamanlı olarak yayınlanan 10 makalelik koordineli bir paketin parçası olup, konsorsiyumun genom tamamlama yöntemlerini insanlardan diğer türlere genişletiyor.eurekalert+1

Rockefeller Dil Nörogenetiği Laboratuvarı başkanı Erich D. Jarvis, "Bu, vokal öğrenme yeteneğine sahip bir türün ikinci tam genomunu temsil ediyor. İlki insandı" dedi. "Eğer vokal öğrenemeyen bir türü vokal öğrenen bir türe dönüştüren anahtar bir molekül varsa, o bir yerlerde bunun içinde saklıdır."rockefeller+1

Teknik Engellerin Aşılması

Kuş genomlarının birleştirilmesi, düzinelerce mikro kromozom ve dizileme cihazlarının durmasına neden olan uzun tekrarlayan DNA dizileri içerdikleri için oldukça zordur. Ekip, son derece uzun DNA moleküllerini okuyabilen yöntemler de dahil olmak üzere birden fazla dizileme teknolojisini birleştirdi ve tekrarlayan diziler cihazları tıkadığında bunları kimyasal olarak temizlemek ve yeniden başlatmak için özel bir protokol geliştirdi.bioengineer+1

Haploid bir hücre hattına dayanan ilk insan telomerden telomere genomundan farklı olarak, bu proje diploid bir organizmadaki iki ebeveyn kromozom setinin doğru bir şekilde ayrılmasını gerektirdi; bu ayrım gen regülasyonu, hastalık duyarlılığı ve davranışları anlamak için büyük önem taşıyor.bioengineer

Sentromerler ve Evrimsel İpuçları

En önemli bulgular arasında, araştırmacılar zebra ispinozunun sentromerlerini haritalandırdı ve kuşların daha önce sadece memelilere özgü olduğu düşünülen oldukça organize bir sentromer mimarisini paylaştığını keşfetti. Jarvis laboratuvarında araştırma görevlisi olan Giulio Formenti, "Sentromer, her hücre bölünmesine izin veren ve kromozomların doğru ayrılmasını sağlayan hücrenin temel bir birimidir" dedi.technologynetworks+1

Genom, şu anda Jarvis ve Formenti'nin eş başkanlığını yürüttüğü Omurgalı Genomları Projesi'ne dahil ediliyor ve burada omurgalı yaşam ağacı genelinde karşılaştırmalı analizler için bir referans görevi görecek.rockefeller+1

Jarvis, "Bu, alanda bir dönüm noktasıdır" dedi. "Artık tüm genom elimizde ve bilim insanları bunu biyolojiyi sorgulamak için kullanabilirler."technologynetworks