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axios+1axios+1axiosUne équipe de chercheurs dirigée par Eric Xing a publié jeudi un article dans Nature Medicine présentant une feuille de route pour construire un "organisme numérique" piloté par l'IA : un système de modèles d'IA connectés capable de simuler la manière dont les médicaments ou les changements génétiques se propagent à travers les molécules, les cellules et, à terme, des personnes entières.axios+1
L'article, intitulé "Comment construire un organisme numérique piloté par l'IA", décrit ce que les auteurs appellent AIDO : un cadre qui relierait des modèles d'IA spécialisés dans l'ADN, les protéines, les cellules, les tissus et les résultats de santé en un seul simulateur dynamique. Xing, cofondateur et scientifique en chef de GenBio AI, président de l'Université d'IA Mohamed bin Zayed à Abou Dabi et professeur d'informatique à l'Université Carnegie Mellon, a comparé le concept à "un simulateur de vol pour la médecine".nature+2
La plupart des outils d'IA existants en biologie traitent une tâche à la fois, comme la prédiction de la forme tridimensionnelle d'une protéine. L'article de Nature Medicine soutient que le domaine doit dépasser ces modèles cloisonnés pour s'orienter vers un système intégré capable de simuler des chaînes d'événements biologiques.axios+1
"Il s'agit vraiment de construire un simulateur de biologie", a déclaré Xing à Axios. Il a précisé que GenBio AI publierait bientôt ce qu'il a appelé "la première implémentation mondiale de la cellule virtuelle". L'entreprise a annoncé une collaboration avec Nvidia en juin pour accélérer le développement de ses modèles mondiaux de cellules virtuelles.genbio+1
GenBio AI n'est pas seule dans la course aux cellules virtuelles. Le Chan Zuckerberg BioHub construit une plateforme ouverte de modèles d'IA pour comprendre et prédire le comportement cellulaire, avec pour objectif déclaré de modéliser les cellules à travers les tissus, les individus et les conditions. Un article de Nature paru en juin a décrit l'effort plus large de plusieurs groupes de recherche visant à convertir des données moléculaires en simulations prédictives du comportement cellulaire.nature+1
Xing a décrit le BioHub de Zuckerberg comme un "concurrent amical", notant que son approche repose davantage sur des modèles de séquence de type modèle de langage, tandis que GenBio combine des données de séquence, de structure, d'imagerie et d'interaction dans un système multi-échelle.axios
Les chercheurs reconnaissent qu'ils sont loin de construire un humain virtuel. L'objectif à court terme est une cellule virtuelle capable de prendre en compte plusieurs types de données biologiques et de prédire les effets des interventions, non pas pour remplacer les études sur les animaux ou les essais cliniques, mais pour servir de filtre éliminant les candidats médicaments les plus faibles avant que les chercheurs ne consacrent des années à les tester. Des défis subsistent concernant les données d'entraînement biaisées, la variabilité des patients et la tendance de l'IA à confondre corrélation et causalité.axios