Un anticorps conçu par IA surpasse les résultats de laboratoire lors du premier test mondial à aveugle

Un anticorps conçu par intelligence artificielle a surpassé le meilleur résultat obtenu après des mois d'expérimentations traditionnelles en laboratoire, selon les résultats du premier test comparatif international à aveugle sur la conception d'anticorps par IA, publiés dans Nature Biotechnology le 25 août 2026.

Aureka Biotechnologies, une société de découverte de médicaments par IA basée en Californie et à Shanghai, a décroché la première place du AIntibody Challenge grâce à un anticorps conçu par son modèle fondation AuraIDE. Cet anticorps a atteint une affinité de liaison de 94,7 picomolaires, soit une amélioration d'environ 2 000 fois par rapport à l'anticorps parental et un résultat plus étroit que les 113 picomolaires obtenus par le meilleur clone expérimental après trois mois de maturation par phage display.prnewswire+1

Un test de type CASP pour l'IA appliquée aux anticorps

Le AIntibody Challenge, organisé par Andrew Bradbury et M. Frank Erasmus, a rassemblé 29 organisations ayant soumis 511 anticorps conçus ou prédits par IA à travers trois épreuves. Conçue sur le modèle des compétitions CASP qui ont validé les prédictions de structures de protéines d'AlphaFold, cette évaluation visait à fournir la première analyse prospective et objective de l'IA dans la découverte d'anticorps.aintibody+2

Lors du Défi 1, considéré comme l'épreuve la plus pertinente sur le plan pratique, les équipes n'ont reçu que des données de séquençage NGS de première étape portant sur la maturation d'affinité d'un anticorps parental contre le domaine de liaison au récepteur de la protéine spicule du SARS-CoV-2. Elles ont ensuite disposé de 14 jours pour concevoir jusqu'à 10 nouvelles séquences d'anticorps, que les organisateurs ont exprimées et testées de façon indépendante dans des conditions uniformes et à aveugle.prnewswire

"Le AIntibody Challenge a été créé pour fournir la première évaluation prospective rigoureuse de la capacité de l'intelligence artificielle à améliorer la découverte d'anticorps grâce à une validation tierce indépendante", a déclaré Andrew Bradbury.phys

Au-delà de la recombinaison

La séquence gagnante d'AuraIDE ne se résumait pas à une simple recombinaison de mutations déjà présentes dans les données expérimentales. Elle différait de l'anticorps parental sur 19 positions d'acides aminés et de la séquence la plus proche du jeu de données d'au moins 12 acides aminés. Le modèle a classé ses propositions aux première, deuxième et cinquième places du Défi 1 et a produit six anticorps sous le seuil des 10 nanomolaires d'affinité ayant également passé avec succès les cinq évaluations de développabilité.prnewswire

Aureka s'est également classée troisième au Défi 2 (classement des candidats existants par affinité) et neuvième au Défi 3 (conception de nouvelles combinaisons de CDR), devenant la seule équipe à se hisser dans le top 10 de l'ensemble des trois épreuves.prnewswire

Repercussions sur le développement de médicaments

Ces résultats suggèrent que l'IA peut désormais remplacer au moins une étape de construction de banques combinatoires et de criblage en laboratoire lors de l'optimisation des anticorps, un processus qui nécessite habituellement plusieurs mois. Les organisateurs du concours ont néanmoins souligné que le succès ne s'est pas transféré de manière constante d'une épreuve à l'autre et qu'"une généralisation large et fiable reste un défi majeur pour le secteur".aintibody

Aureka, qui a bouclé un tour de table de Série B de 100 millions de dollars au début du mois d'août, a levé près de 200 millions de dollars à ce jour et maintient des collaborations avec plusieurs entreprises pharmaceutiques mondiales.biospace+1