Protilátka navržená AI v prvním zaslepeném srovnávacím testu překonala výsledky z laboratoře

Protilátka navržená umělou inteligencí překonala nejlepší výsledky z několikaměsíčních tradičních laboratorních experimentů, ukázaly výsledky prvního mezinárodního zaslepeného srovnávacího testu pro návrh protilátek pomocí AI, které byly 25. srpna 2026 publikovány v časopise Nature Biotechnology.

Společnost Aureka Biotechnologies, vývojář léků pomocí AI sídlící v Kalifornii a Šanghaji, získala první místo v soutěži AIntibody Challenge. Její základní model AuraIDE navrhl protilátku, která dosáhla vazebné afinity 94,7 pikomolaru, což představuje přibližně 2 000násobné zlepšení oproti původní protilátce a pevnější vazbu, než jakou měl nejlepší experimentálně získaný klon s hodnotou 113 pikomolarů po třech měsících fágového displeje.prnewswire+1

Test pro AI v oblasti protilátek ve stylu CASP

Soutěž AIntibody Challenge, kterou zorganizovali Andrew Bradbury a M. Frank Erasmus, přilákala 29 organizací, jež v rámci tří úkolů přihlásily 511 protilátek navržených nebo předpovězených pomocí AI. Srovnávací test navržený po vzoru soutěží CASP, které prověřily předpovědi struktury bílkovin systémem AlphaFold, měl za cíl poskytnout první objektivní a prospektivní hodnocení AI při vývoji protilátek.aintibody+2

V prvním úkolu, který byl považován za prakticky nejvýznamnější, dostaly týmy pouze data z prvního kola sekvenování NGS z afinitního zrání původní protilátky proti receptorové vazebné doméně spike proteinu viru SARS-CoV-2. Během 14 dnů pak měly navrhnout až 10 nových sekvencí protilátek, které organizátoři nezávisle vyjádřili a otestovali za jednotných zaslepených podmínek.prnewswire

"Soutěž AIntibody Challenge byla založena s cílem poskytnout první důkladné prospektivní zhodnocení schopností umělé inteligence zlepšit vývoj protilátek s využitím nezávislého ověření třetí stranou," uvedl Bradbury.phys

Více než jen rekombinace

Vítězná sekvence modelu AuraIDE nebyla pouhou rekombinací mutací již obsažených v experimentálních datech. Od původní protilátky se lišila na 19 pozicích aminokyselin a od nejbližší sekvence v datové sadě nejméně o 12 aminokyselin. Model obsadil první, druhé a páté místo v žebříčku prvního úkolu a vytvořil šest protilátek s afinitou pod 10 nanomolarů, které navíc prošly všemi pěti hodnoceními vývojové způsobilosti.prnewswire

Společnost Aureka se umístila také na třetím místě ve druhém úkolu (řazení stávajících kandidátů podle afinity) a na devátém místě ve třetím úkolu (návrh nových kombinací CDR), čímž se stala jediným týmem, který se dostal do první desítky ve všech třech úkolech.prnewswire

Důsledky pro vývoj léků

Výsledky naznačují, že AI již dokáže nahradit alespoň jedno kolo konstrukce kombinatorických knihoven a laboratorního screeningu při optimalizaci protilátek, což je proces, který obvykle trvá měsíce. Organizátoři soutěže AIntibody však poznamenali, že úspěch se nepřenášel konzistentně napříč úkoly a že "široká a spolehlivá generalizace zůstává pro tento obor důležitou výzvou".aintibody

Společnost Aureka, která začátkem srpna dokončila investiční kolo série B ve výši 100 milionů dolarů, dosud získala téměř 200 milionů dolarů a spolupracuje s několika globálními farmaceutickými společnostmi.biospace+1