Dirbtinio intelekto sukurtas antikūnas pirmajame tarptautiniame vertinime pranoko laboratorijos rezultatus

Dirbtinio intelekto sukurtas antikūnas pranoko geriausią rezultatą, gautą per kelis mėnesius trukusius tradicinius laboratorinius eksperimentus, rodo 2026 m. rugpjūčio 25 d. žurnale „Nature Biotechnology“ publikuoti pirmojo tarptautinio aklanojo vertinimo rezultatai.

JAV Kalifornijos valstijoje ir Šanchajuje veikianti DI vaistų kūrimo bendrovė „Aureka Biotechnologies“ užėmė pirmąją vietą „AIntibody Challenge“ konkurse. Jos bazinis modelis „AuraIDE“ sukūrė antikūną, kurio prisijungimo giminingumas siekia 94,7 pikomolių: tai yra maždaug 2 000 kartų geresnis rezultatas nei pradinio antikūno ir stipresnis nei 113 pikomolių rodiklis, kurį per tris mėnesius trukusį fago brandinimą pasiekė geriausias eksperimentiniu būdu išvestas klonas.prnewswire+1

CASP stiliaus testas antikūnų DI

Andrew Bradbury ir M. Frank Erasmus organized „AIntibody Challenge“ konkurse dalyvavo 29 organizacijos, kurios trijose užduotyse pateikė 511 DI sukurtų arba prognozuotų antikūnų. Vertinimas buvo parengtas pagal CASP konkursų modelį, padėjusį patvirtinti „AlphaFold“ baltymų struktūros prognozes, ir juo siekta pateikti pirmąjį objektyvų bei perspektyvų DI taikymo antikūnų paieškoje įvertinimą.aintibody+2

Pirmojoje užduotyje, laikomoje praktiškai svarbiausia, komandos gavo tik pirmojo etapo NGS sekoskaitos duomenis apie pradinio antikūno giminingumo brandinimą prieš SARS-CoV-2 spyglio baltymo receptorių rišantį domeną. Tada jos turėjo 14 dienų sukurti iki 10 naujų antikūnų sekų, kurias organizatoriai nepriklausomai ekspresavo ir išbandė vienodomis aklosiomis sąlygomis.prnewswire

„AIntibody Challenge buvo įkurtas siekiant pateikti pirmąjį griežtą perspektyvų dirbtinio intelekto gebėjimo patobulinti antikūnų atradimą įvertinimą, naudojant nepriklausomą trečiųjų šalių patikrinimą“, sakė Bradbury.phys

Daugiau nei tiesiog rekombinacija

Modelio „AuraIDE“ nugalėjusioji seka nebuvo tiesioginė eksperimentiniuose duomenyse jau buvusių mutacijų rekombinacija. Ji skyrėsi nuo pradinio antikūno 19 amino rūgščių pozicijų, o nuo artimiausios duomenų rinkinio sekos: bent 12 amino rūgščių. Modelis užėmė pirmą, antrą ir penktą vietas pirmoje užduotyje ir sukūrė šešis mažesnio nei 10 nanomolių giminingumo antikūnus, kurie taip pat išlaikė visus penkis pritaikomumo vystymui vertinimus.prnewswire

Bendrovė „Aureka“ taip pat užėmė trečią vietą antroje užduotyje (esamų kandidatų rikiavimas pagal giminingumą) ir devintą vietą trečioje užduotyje (naujų CDR kombinacijų kūrimas), todėl tapo vienintele komanda, patekusia į geriausiųjų dešimtuką visose trijose užduotyse.prnewswire

Svarba vaistų kūrimui

Rezultatai rodo, kad DI dabar gali pakeisti bent vieną kombinatorinių bibliotekų kūrimo ir praktinio laboratorinio skreiningo etapo ratą optimizuojant antikūnus, o šis procesas paprastai trunka kelis mėnesius. Vis dėlto „AIntibody“ organizatoriai pažymėjo, kad sėkmė nebuvo nuosekli visose užduotyse ir kad „platus ir patikimas apibendrinimas išlieka svarbiu iššūkiu šioje srityje“.aintibody

Bendrovė „Aureka“, rugpjūčio pradžioje baigusi 100 mln. JAV dolerių B serijos finansavimo etapą, iki šiol pritraukė beveik 200 mln. JAV dolerių ir bendradarbiauja su keliomis tarptautinėmis farmacijos bendrovėmis.biospace+1