Επιστήμονες δημοσιεύουν στο Nature τη μεγαλύτερη βάση δεδομένων για μοντέλα καρκίνου

Μια διεθνής ομάδα επιστημόνων παρουσίασε μία από τις πιο εκτενείς συλλογές μοντέλων καρκίνου που προέρχονται από ασθενείς, προσφέροντας στους ερευνητές νέα εργαλεία για τη μελέτη της βιολογίας των όγκων και την επιτάχυνση της ανάπτυξης εξατομικευμένων θεραπειών. Η συλλογή, που δημοσιεύθηκε την Τετάρτη στο Nature, αποτελεί προϊόν της πρωτοβουλίας Human Cancer Models Initiative, μιας δεκαετούς συνεργασίας υπό την ηγεσία του National Cancer Institute και εταίρων όπως το Cancer Research UK, το Wellcome Sanger Institute και το Hubrecht Organoid Technology.vai+1

Ένας πόρος για την ανακάλυψη

Η συλλογή περιλαμβάνει 665 εργαστηριακά μοντέλα που προέρχονται από 2.780 δότες σε 25 τύπους καρκίνου. Από αυτά, τα 522 περιλαμβάνουν λεπτομερή κλινικά δεδομένα, 153 αντιπροσωπεύουν σπάνιες μορφές καρκίνου και 71 προέρχονται από άτομα μη ευρωπαϊκής καταγωγής. Κάθε μοντέλο συνοδεύεται από βαθιά γονιδιωματικά, επιγονιδιωματικά και μεταγραφικά δεδομένα από τον αντίστοιχο όγκο, δημιουργώντας μοριακά προφίλ που βοηθούν τους ερευνητές να συνδέσουν τα χαρακτηριστικά του όγκου με τα πειραματικά αποτελέσματα.nih+1

"Συνδέοντας τα μοντέλα που προέρχονται από ασθενείς με λεπτομερή μοριακά και κλινικά δεδομένα, η HCMI έχει δημιουργήσει ένα πλαίσιο για την προώθηση τόσο της κατανόησής μας για τον καρκίνο όσο και των αποτελεσμάτων για τους ασθενείς", δήλωσε ο Anthony Letai, διευθυντής του NCI.nih

Μοντέλα που αντικατοπτρίζουν τους όγκους

Ένα κεντρικό εύρημα της έρευνας είναι ότι τα εργαστηριακά μοντέλα διατηρούν πιστά τη βιολογία των όγκων από τους οποίους προήλθαν. Η ανάλυση 421 ζευγών όγκου-μοντέλου έδειξε 97,8% συμφωνία στις γενετικές αλλοιώσεις, 95% συμφωνία στα επιγενετικά χαρακτηριστικά και 92% ομοιότητα στα πρότυπα έκφρασης RNA. Αυτά τα αποτελέσματα διατηρήθηκαν ακόμη και μετά από παρατεταμένη ανάπτυξη σε εργαστηριακές συνθήκες.manilatimes+1

"Οι συνθήκες καλλιέργειας για την ανάπτυξη των οργανοειδών δεν αλλοίωσαν τη γενετική τους σύσταση ή τους βιολογικούς τους φαινότυπους", δήλωσε ο Louis M. Staudt από το Κέντρο Έρευνας Καρκίνου του NCI. "Η ελπίδα και η προσδοκία είναι ότι η στενή ομοιότητα μεταξύ του όγκου ενός ασθενούς και του παραγόμενου οργανοειδούς μοντέλου σημαίνει ότι οι ερευνητές μπορούν να τα χρησιμοποιήσουν για να ανακαλύψουν ευπάθειες που μπορούν να αξιοποιηθούν θεραπευτικά".nih

Ο οργανισμός American Type Culture Collection, ο μοναδικός εξουσιοδοτημένος διανομέας της συλλογής οργανοειδών HCMI, χαρακτήρισε τη μελέτη "ακριβώς το είδος της ανεξάρτητης, δημοσιευμένης επικύρωσης προηγμένων μοντέλων που απαιτεί ο τομέας μας".manilatimes

Διεύρυνση της πρόσβασης

Όλα τα μοντέλα διατίθενται στην επιστημονική κοινότητα μέσω του ATCC, μαζί με τα σχετικά γονιδιωματικά, κλινικά και μοριακά δεδομένα. Το άρθρο στο Nature συνοδεύεται από συμπληρωματικές μελέτες υπό την καθοδήγηση ερευνητών από το Wellcome Sanger Institute, το Broad Institute του MIT και του Harvard, και το Cold Spring Harbor Laboratory. Ερευνητές που μελετούν το γλοιοβλάστωμα, για παράδειγμα, έχουν ήδη χρησιμοποιήσει τα μοντέλα για να εντοπίσουν γενετικά χαρακτηριστικά που συνδέονται με την ανθεκτικότητα στη χημειοθεραπεία με τεμοζολομίδη, καταδεικνύοντας τις δυνατότητες της συλλογής για τη μελέτη της θεραπευτικής αντοχής.newsoffice.mit+1

"Αυτά τα μοντέλα είναι εξαιρετικές αναπαραστάσεις των αρχικών όγκων", δήλωσε ο Peter W. Laird από το Van Andel Institute, συν-συγγραφέας της μελέτης. "Είμαστε ενθουσιασμένοι που μοιραζόμαστε αυτόν τον πόρο με την επιστημονική κοινότητα και ελπίζουμε ότι θα επιταχύνει τις ανακαλύψεις στον καρκίνο".vai