Vísindamenn við Penn nota gervigreind til að finna ný skotmörk fyrir CAR T-meðferð

Vísindamenn við Penn Medicine hafa þróað ramma fyrir gervigreind sem sameinar stór málalíkön og mannlega vísindalega sérfræðiþekkingu til að uppgötva kerfisbundið ný skotmörk fyrir CAR T-frumumeðferð, og birtu niðurstöður sínar á miðvikudaginn í tímaritinu Cell.miragenews+2

Liðið, undir forystu Daniels Baker, sem lauk doktorsgráðu sinni við Penn í desember 2025 undir handleiðslu frumkvöðulsins í CAR T-frumumeðferð, Carl June, og Zoltan Arany, deildarforseta lífeðlisfræðideildar við Penn, smíðaði það sem þeir lýsa sem „mann-í-lykkjunni“ gervigreindarkerfi sem er hannað til að takast á við einn af viðvarandi flöskuhálsum á þessu sviði: að bera kennsl á hvaða mótefnavaka ætti að hanna CAR T-frumur til að ráðast á.miragenews+1

##nál í stækkandi heystakk

„Að uppgötva gott CAR-skotmark er eins og að reyna að finna nál í heystakk, nema hvað heystakkurinn heldur áfram að stækka eftir því sem fleiri raðgreiningargögn verða aðgengileg,“ sagði Baker. „Við töldum að þetta væri sterkt notkunartilvik fyrir gervigreind vegna þess að einn af styrkleikum stórra málalíkana er það magn gagna sem þau geta tekið tillit til. Mannlegir sérfræðingar skara fram úr í að kafa djúpt, á meðan LLM-líkön eru góð í að skoða breitt úrval gagna.“miragenews+1

Ramminn samþættir gagnasöfn fyrir RNA-raðgreiningu úr stökum frumum og keyrir LLM-undirstaða hermun til að tilnefna og forgangsraða hugsanlegum skotmörkum, sem skilar stuttum lista fyrir sérfræðilega líffræðilega staðfestingu. Nálgunin var hönnuð til að vera óháð sjúkdómum og samhæf við framtíðar gervigreindarlíkön.sciencedirect+1

Frá reikniriti til æxliseyðandi frumna

Sem sönnun á hugmyndinni einbeitti liðið sér að húðkrabbameini og benti á glýkóprótein sem ekki er meinvirkt sortuæxlisprótein B (GPNMB) sem helsta frambjóðandann. Þeir hönnuðu síðan CAR T-frumur sem beindust að GPNMB, sem sýndu öfluga æxliseyðandi virkni í músamódelum af mörgum tegundum krabbameins, þar á meðal sortuæxli, hvítblæði og ristilkrabbameini.cell+3

Í meðfylgjandi athugasemd í Cell var tekið fram að GPNMB CAR T-meðferð leiddi til sjúkdómshlés án bakslags í xenograft-módelum.cell

Að stækka út fyrir blóðkrabbamein

Þó að CAR T-frumumeðferð hafi gjörbylt meðferð við ýmsum blóðkrabbameinum frá því að hún var þróuð við Penn, beinast núverandi útgáfur sem FDA hefur samþykkt að mótefnavökum sem eru víða tjáðir eingöngu í illkynja blóðsjúkdómum. Að útvíkka meðferðina yfir í föst æxli hefur verið hamlað af erfiðleikum við að finna viðeigandi skotmörk — ferli sem vísindamennirnir segja að rammi þeirra geti þjappað úr mánuðum af handavinnu niður í vikur.x+2

Kerfið var smíðað til að gera vísindamönnum kleift að beita því á mismunandi tegundir sjúkdóma án þess að endurhanna undirliggjandi arkitektúr, sem gæti hugsanlega flýtt fyrir þróun CAR T fyrir bæði krabbamein og sjúkdóma sem ekki eru krabbameinstengdir.miragenews+1