Výzkumníci z Penn využívají AI k hledání nových cílů pro CAR T terapii

Výzkumníci z Penn Medicine vyvinuli rámec umělé inteligence, který kombinuje velké jazykové modely s lidskou vědeckou expertízou pro systematické objevování nových cílů pro terapii CAR T buňkami. Své poznatky publikovali ve středu v časopise Cell.miragenews+2

Tým vedený Danielem Bakerem, který dokončil doktorát na Penn v prosinci 2025 pod vedením průkopníka terapie CAR T buňkami Carla Junea a Zoltana Aranyho, vedoucího katedry fyziologie na Penn, vytvořil systém AI typu „human-in-the-loop“ (člověk v procesu), navržený k řešení jednoho z nejtrvalejších úzkých hrdel v oboru: identifikace antigenů, na které by měly být CAR T buňky navrženy k útoku.miragenews+1

Jehla v rostoucí kupce sena

„Objevení dobrého CAR cíle je jako hledání jehly v kupce sena, s tím rozdílem, že kupka sena stále roste, jak jsou k dispozici další sekvenační data,“ řekl Baker. „Mysleli jsme si, že by to bylo silné využití pro AI, protože jednou ze silných stránek velkých jazykových modelů je množství dat, která mohou zvážit. Lidští experti vynikají v hloubkové analýze, zatímco LLM jsou dobré v přehledu široké škály dat.“miragenews+1

Rámec integruje datové sady sekvenování jednotlivých buněk a spouští simulace založené na LLM k nominaci a prioritizaci potenciálních cílů, čímž vytváří užší výběr pro expertní biologickou validaci. Přístup byl navržen tak, aby byl nezávislý na onemocnění a kompatibilní s budoucími modely AI.sciencedirect+1

Od algoritmu k buňkám zabíjejícím nádory

Jako důkaz konceptu se tým zaměřil na rakovinu kůže a identifikoval glykoprotein non-metastatic melanoma protein B (GPNMB) jako hlavního kandidáta. Poté zkonstruovali CAR T buňky zaměřené na GPNMB, které vykázaly robustní aktivitu zabíjející nádory u myších modelů různých typů rakoviny, včetně melanomu, leukémie a kolorektálního karcinomu.cell+3

Doprovodný komentář v časopise Cell poznamenal, že léčba GPNMB CAR T vedla k remisi bez relapsu u xenograftových modelů.cell

Rozšíření mimo rakovinu krve

Zatímco terapie CAR T buňkami transformovala léčbu několika druhů rakoviny krve od svého vývoje na Penn, současné verze schválené FDA se zaměřují na antigeny široce exprimované pouze u malignit krve. Rozšíření terapie na solidní nádory bylo brzděno obtížností nalezení vhodných cílů – proces, který podle výzkumníků jejich rámec dokáže zkrátit z měsíců manuální práce na týdny.x+2

Systém byl vytvořen tak, aby umožnil výzkumníkům aplikovat jej napříč typy onemocnění bez nutnosti přepracování základní architektury, což potenciálně urychlí vývoj CAR T pro rakovinu i nenádorová onemocnění.miragenews+1