Vísindamenn birta stærsta safn krabbameinslíkana í Nature

Alþjóðlegt teymi vísindamanna hefur kynnt eitt umfangsmesta safn krabbameinslíkana úr sjúklingum til þessa, sem veitir rannsakendum ný tæki til að rannsaka líffræði æxla og flýta fyrir þróun persónumiðaðra meðferða. Safnið, sem birt var á miðvikudag í Nature, er afrakstur Human Cancer Models Initiative, áratugalangs samstarfs undir forystu National Cancer Institute og samstarfsaðila á borð við Cancer Research UK, Wellcome Sanger Institute og Hubrecht Organoid Technology.vai+1

Auðlind fyrir vísindin

Safnið samanstendur af 665 rannsóknarlíkönum sem fengin eru frá 2.780 gjöfum með 25 mismunandi tegundir krabbameins. Af þeim fylgja ítarleg klínísk gögn með 522 líkönum, 153 eru af sjaldgæfum krabbameinum og 71 kemur frá einstaklingum sem ekki eru af evrópskum uppruna. Hvert líkan er parað við ítarleg erfða-, epigenetísk- og umritunargögn úr samsvarandi æxli, sem skapar sameindasnið sem hjálpa rannsakendum að tengja eiginleika æxla við niðurstöður tilrauna.nih+1

"Með því að tengja líkön úr sjúklingum við ítarleg sameinda- og klínísk gögn hefur HCMI komið á fót ramma til að efla bæði skilning okkar á krabbameini og árangur fyrir sjúklinga," sagði Anthony Letai, forstöðumaður NCI.nih

Líkön sem spegla æxlin

Ein helsta niðurstaða rannsóknarinnar er að rannsóknarlíkönin varðveita líffræði æxlanna sem þau eru dregin af með mikilli nákvæmni. Greining á 421 pari af æxlum og líkönum sýndi 97,8% samræmi í erfðabreytingum, 95% samræmi í epigenetískum eiginleikum og 92% líkingu í RNA tjáningarmynstri. Þessar niðurstöður héldust jafnvel eftir langvarandi ræktun við rannsóknarstofuaðstæður.manilatimes+1

"Ræktunarskilyrði líffæranna breyttu ekki erfðasamsetningu þeirra eða líffræðilegum eiginleikum," sagði Louis M. Staudt hjá Center for Cancer Research hjá NCI. "Vonin og væntingin er sú að mikil líkindi milli æxlis sjúklings og líffæralíkansins þýði að rannsakendur geti notað þau til að uppgötva veikleika sem hægt er að nýta meðferðarlega".nih

American Type Culture Collection, eini viðurkenndi dreifingaraðili HCMI líffærasafnsins, kallaði rannsóknina "nákvæmlega þá tegund af óháðri, birtri staðfestingu á háþróuðum líkönum sem sviðið okkar þarfnast".manilatimes

Aukið aðgengi

Öll líkön eru gerð aðgengileg vísindasamfélaginu í gegnum ATCC, ásamt tengdum erfða-, klínískum og sameindagögnum. Greinin í Nature er studd af fylgirannsóknum undir forystu vísindamanna við Wellcome Sanger Institute, Broad Institute of MIT og Harvard, og Cold Spring Harbor Laboratory. Rannsakendur í glioblastoma hafa til dæmis þegar notað líkönin til að greina erfðaeiginleika sem tengjast ónæmi fyrir krabbameinslyfinu temozolomide, sem sýnir fram á möguleika safnsins til að rannsaka meðferðarónæmi.newsoffice.mit+1

"Þessi líkön eru frábærar framsetningar á upprunalegu æxlunum," sagði Peter W. Laird hjá Van Andel Institute, einn af höfundum rannsóknarinnar. "Við erum spennt að deila þessari auðlind með vísindasamfélaginu og vonum að hún muni flýta fyrir byltingum í krabbameinsrannsóknum".vai