Αντίσωμα σχεδιασμένο με ΤΝ ξεπερνά τα εργαστηριακά αποτελέσματα σε πρώτη παγκόσμια τυφλή δοκιμή

Ένα αντίσωμα σχεδιασμένο με τεχνητή νοημοσύνη ξεπέρασε το καλύτερο αποτέλεσμα μηνών παραδοσιακών εργαστηριακών πειραμάτων, σύμφωνα με τα αποτελέσματα της πρώτης διεθνούς τυφλής συγκριτικής αξιολόγησης για τον σχεδιασμό αντισωμάτων με ΤΝ, που δημοσιεύθηκαν στο Nature Biotechnology στις 25 Αυγούστου 2026.

Η Aureka Biotechnologies, μια εταιρεία ανακάλυψης φαρμάκων μέσω ΤΝ με έδρα την Καλιφόρνια και τη Σανγκάη, κατέκτησε την πρώτη θέση στο AIntibody Challenge με ένα αντίσωμα που σχεδιάστηκε από το θεμελιώδες μοντέλο της AuraIDE, πετυχαίνοντας συγγένεια σύνδεσης 94,7 picomolar, μια βελτίωση περίπου 2.000 φορές σε σχέση με το μητρικό αντίσωμα και ισχυρότερη από τα 113 picomolar που πέτυχε ο καλύτερος πειραματικά παραγόμενος κλώνος έπειτα από τρεις μήνες ωρίμανσης βακτηριοφάγων.prnewswire+1

Μια δοκιμασία τύπου CASP για την ΤΝ αντισωμάτων

Το AIntibody Challenge, που διοργανώθηκε από τους Andrew Bradbury και M. Frank Erasmus, προσέλκυσε 29 οργανισμούς που υπέβαλαν 511 αντισώματα σχεδιασμένα ή προβλεπόμενα από ΤΝ σε τρεις δοκιμασίες. Βασισμένη στα πρότυπα των διαγωνισμών CASP που επικύρωσαν τις προβλέψεις πρωτεϊνικής δομής του AlphaFold, η αξιολόγηση είχε ως στόχο να παράσχει την πρώτη αντικειμενική, προοπτική αξιολόγηση της ΤΝ στην ανακάλυψη αντισωμάτων.aintibody+2

Στη Δοκιμασία 1, που θεωρήθηκε ως η πιο πρακτικά σημαντική, οι ομάδες έλαβαν μόνο δεδομένα αλληλούχισης NGS πρώτου γύρου από την ωρίμανση συγγένειας ενός μητρικού αντίσωματος έναντι της περιοχής σύνδεσης υποδοχέα της πρωτεΐνης ακίδας του SARS-CoV-2. Στη συνέχεια είχαν 14 ημέρες για να σχεδιάσουν έως και 10 νέες αλληλουχίες αντισωμάτων, τις οποίες οι διοργανωτές εξέφρασαν και δοκίμασαν ανεξάρτητα υπό ενιαίες τυφλές συνθήκες.prnewswire

«Το AIntibody Challenge δημιουργήθηκε για να παράσχει την πρώτη αυστηρή προοπτική αξιολόγηση της ικανότητας της τεχνητής νοημοσύνης να βελτιώνει την ανακάλυψη αντισωμάτων χρησιμοποιώντας ανεξάρτητη επικύρωση από τρίτους», δήλωσε ο Bradbury.phys

Πέρα από τον ανασυνδυασμό

Η νικητήρια αλληλουχία του AuraIDE δεν ήταν ένας απλός ανασυνδυασμός μεταλλάξεων που υπήρχαν ήδη στα πειραματικά δεδομένα. Διέφερε από το μητρικό αντίσωμα σε 19 θέσεις αμινοξέων και από την πλησιέστερη αλληλουχία στο σύνολο δεδομένων κατά τουλάχιστον 12 αμινοξέα. Το μοντέλο κατέλαβε την πρώτη, τη δεύτερη και την πέμπτη θέση στον πίνακα κατατάξεων της Δοκιμασίας 1 και παρήγαγε έξι αντισώματα με συγγένεια κάτω των 10 nanomolar, τα οποία επίσης πέρασαν και τις πέντε αξιολογήσεις δυνατότητας ανάπτυξης.prnewswire

Η Aureka κατέλαβε επίσης την τρίτη θέση στη Δοκιμασία 2 (κατάταξη υπαρχόντων υποψηφίων βάσει συγγένειας) και την ένατη θέση στη Δοκιμασία 3 (σχεδιασμός νέων συνδυασμών CDR), καθιστώντας την τη μόνη ομάδα που τερμάτισε στην πρώτη δεκάδα και στις τρεις δοκιμασίες.prnewswire

Επιπτώσεις στην ανακάλυψη φαρμάκων

Τα αποτελέσματα υποδηλώνουν ότι η ΤΝ μπορεί πλέον να αντικαταστήσει τουλάχιστον έναν γύρο κατασκευής συνδυαστικής βιβλιοθήκης και εργαστηριακής διαλογής στη βελτιστοποίηση αντισωμάτων, μια διαδικασία που συνήθως απαιτεί μήνες. Ωστόσο, οι διοργανωτές του AIntibody σημείωσαν ότι η επιτυχία δεν μεταφέρθηκε με συνέπεια μεταξύ των δοκιμασιών και ότι «η ευρεία, αξιόπιστη γενίκευση παραμένει μια σημαντική πρόκληση για τον τομέα».aintibody

Η Aureka, η οποία ολοκλήρωσε έναν γύρο χρηματοδότησης Series B ύψους 100 εκατομμυρίων δολαρίων νωρίτερα τον Αύγουστο, έχει συγκεντρώσει σχεδόν 200 εκατομμύρια δολάρια μέχρι σήμερα και διατηρεί συνεργασίες με αρκετές παγκόσμιες φαρμακευτικές εταιρείες.biospace+1