Nobel ödüllü bilim insanının girişimi ilk tam sanal insan hücresi modelini tanıttı

GenBio AI, Salı günü, insan hücresi davranışını DNA ve RNA'dan proteinlere ve tüm hücre dinamiklerine kadar tam biyolojik hiyerarşisi boyunca, hem doğal durumunda hem de ilaçlara ve diğer müdahalelere yanıt olarak simüle edebilen ilk sanal hücre "dünya modeli" olarak tanımladığı AIDO Cell'i tanıttı.businesswire

Palo Alto merkezli girişim, 2024 Nobel ödüllü David Baker ve yapay zeka bilimcisi Eric Xing tarafından kuruldu. Şirket, AIDO Cell'i, sadece bireysel proteinlerin yapısını tahmin eden Google DeepMind'ın Alphabet Inc. ↘ 0.05% AlphaFold gibi araçlarının ötesinde bir adım olarak konumlandırıyor. AIDO Cell, tüm bir hücrenin moleküler mekanizmasının entegre bir sistem olarak nasıl davrandığını modellemeyi amaçlıyor.statnews

Baker, STAT News'e verdiği demeçte, "AlphaFold ile bir evin yapısını tahmin ediyorsunuz veya o şehirdeki bir kişiyi öğreniyorsunuz, oysa AIDO Cell'de tüm şehrin nasıl çalıştığını tahmin ediyorsunuz" dedi.statnews

Nasıl Çalışır?

AIDO Cell, onu hem çok ölçekli hem de durum bilgisine sahip kılan bir dünya modeli mimarisi üzerine inşa edilmiştir. Bir araştırmacı, hücreyi herhangi bir seviyede bozabilir (örneğin bir geni devre dışı bırakarak) ve etkilerin gen regülasyonundan protein davranışına ve bir bütün olarak hücreye nasıl yayıldığını gözlemleyebilir. Sistem önceki müdahaleleri hatırladığı için, bozulma dizileri izole tahminler olarak ele alınmak yerine birbirinin üzerine inşa edilebilir.businesswire

Kurucu ortaklar Eric Xing, Eran Segal ve Le Song tarafından Nature Medicine'da yayınlanan bir makale, üç aşamalı bir yaklaşımı tanımlıyor: bireysel biyolojik modaliteler için temel modeller oluşturmak, bu modelleri ölçekler arasında bağlamak ve ardından tüm ağı tek bir tutarlı sistem haline getirmek.lifespan

Erken Sonuçlar ve Sınırlamalar

Erken bir gösterimde GenBio, imatinib'in lösemi hücreleri üzerindeki etkilerini modellemek için AIDO Cell'i kullandı ve sistemin ilacın bilinen etki mekanizmasını hücresel biyolojinin birkaç seviyesinde yeniden ürettiğini buldu.businesswire

Sistem şu anda yaygın olarak kullanılan iki ölümsüzleştirilmiş insan hücre hattını destekliyor: kronik miyeloid lösemi hastasından türetilen K562 ve karaciğer tümöründen türetilen HepG2. Ek hücre tipleri geliştirme aşamasındadır. GenBio bu sürümü "bir önizleme, erken ama işlevsel bir gösterim" olarak tanımlıyor ve bu yılın ilerleyen dönemlerinde ve gelecek yıl daha gelişmiş sürümleri yayınlamayı planlıyor.businesswire

İlaç Keşfi İçin Çıkarımlar

Şirket, AIDO Cell'i, ilaç geliştirme hattına giren her 10.000 bileşikten sadece birinin kliniğe ulaştığı farmasötik araştırmalar için potansiyel bir sanal test alanı olarak çerçeveliyor. Eski Sanofi ↗ 1.26% yapay zeka başkanı ve kurucu ortak Ziv Bar-Joseph, "AIDO Cell gibi bir sistem, şirketlerin birkaç ilaç adayını hızlı ve doğru bir şekilde değerlendirmesini sağlayarak, bugün mümkün olandan yıllar önce daha iyi, daha güvenli ve daha verimli tedavilere yol açıyor" dedi.businesswire

GenBio, akademi, biyoteknoloji ve ilaç sektöründeki bilim insanları için erken erişimli bir akademik iş birliği programı başlatmaya hazırlanıyor.lifespan+1