Nobelio premijos laureato startuolis pristatė pirmąjį virtualų žmogaus ląstelės modelį

„GenBio AI“ antradienį pristatė „AIDO Cell“ – sistemą, kurią apibūdina kaip pirmąjį virtualų ląstelės „pasaulio modelį“, gebantį simuliuoti žmogaus ląstelės elgseną visoje biologinėje hierarchijoje – nuo DNR ir RNR per baltymus iki visos ląstelės dinamikos – tiek natūralioje būsenoje, tiek reaguojant į vaistus ar kitas intervencijas.businesswire

Palo Alto įsikūręs startuolis, kurį įkūrė 2024 m. Nobelio premijos laureatas David Baker ir dirbtinio intelekto mokslininkas Eric Xing, pristato „AIDO Cell“ kaip žingsnį į priekį, palyginti su tokiais įrankiais kaip „Alphabet Inc.“ ↗ 0.09% „DeepMind“ „AlphaFold“, kuris prognozuoja atskirų baltymų struktūrą. „AIDO Cell“ siekia modeliuoti, kaip visos ląstelės molekulinė mašinerija veikia kaip integruota sistema.statnews

„Su „AlphaFold“ jūs prognozuojate vieno namo struktūrą arba sužinote apie vieną žmogų tame mieste, o su „AIDO Cell“ jūs tarsi prognozuojate, kaip veikia visas miestas“, – sakė Baker „STAT News“.statnews

Kaip tai veikia

„AIDO Cell“ sukurta remiantis pasaulio modelio architektūra, kuri daro ją daugiaskalę ir išsaugančią būseną. Tyrėjas gali paveikti ląstelę bet kuriame lygmenyje – pavyzdžiui, išjungti geną – ir stebėti, kaip poveikis kaskadiškai plinta nuo genų reguliavimo per baltymų elgseną iki visos ląstelės. Kadangi sistema prisimena ankstesnes intervencijas, perturbacijų sekos gali viena kitą papildyti, o ne būti traktuojamos kaip izoliuotos prognozės.businesswire

Kartu paskelbtame „Nature Medicine“ straipsnyje įkūrėjai Eric Xing, Eran Segal ir Le Song aprašo trijų etapų metodą: pamatinių modelių kūrimą atskiriems biologiniams modalumams, tų modelių susiejimą per skirtingas skales ir galiausiai viso tinklo suderinimą į vieną nuoseklią sistemą.lifespan

Ankstyvieji rezultatai ir apribojimai

Pirminės demonstracijos metu „GenBio“ panaudojo „AIDO Cell“ imatinibo poveikiui leukemijos ląstelėms modeliuoti ir nustatė, kad sistema atkartojo žinomą vaisto veikimo mechanizmą įvairiais ląstelių biologijos lygmenimis.businesswire

Šiuo metu sistema palaiko dvi plačiai naudojamas nemirtingas žmogaus ląstelių linijas – K562, gautą iš lėtinės mieloidinės leukemijos paciento, ir HepG2, gautą iš kepenų naviko, o kitų tipų ląstelės yra kuriamos. „GenBio“ šį pristatymą apibūdina kaip „peržiūrą, ankstyvą, bet funkcionalią demonstraciją“ ir planuoja išleisti pažangesnes versijas vėliau šiais ir kitais metais.businesswire

Poveikis vaistų kūrimui

Bendrovė „AIDO Cell“ pristato kaip potencialią virtualią bandymų aikštelę farmacijos tyrimams, kur tik apie vienas iš 10 000 junginių, patenkančių į vaistų kūrimo procesą, galiausiai pasiekia kliniką. „Tokia sistema kaip „AIDO Cell“ leidžia įmonėms greitai ir tiksliai įvertinti kelis vaistų kandidatus, todėl geresnis, saugesnis ir efektyvesnis gydymas pasiekiamas metais anksčiau nei įmanoma šiandien“, – sakė įkūrėjas ir vyriausiasis mokslo pareigūnas Ziv Bar-Joseph, buvęs „Sanofi“ ↗ 1.49% dirbtinio intelekto vadovas.businesswire

„GenBio“ ruošiasi pradėti ankstyvosios prieigos bendradarbiavimo programą mokslininkams akademinėje bendruomenėje, biotechnologijų ir farmacijos sektoriuose.lifespan+1