Nobelpristagarens startup avtäcker första fullständiga virtuella mänskliga cellmodellen

GenBio AI avtäckte på tisdagen AIDO Cell, ett system som de beskriver som den första virtuella cellmodellen med förmåga att simulera mänskligt cellbeteende genom hela den biologiska hierarkin, från DNA och RNA via proteiner till helcelldynamik, både i naturligt tillstånd och som svar på läkemedel och andra ingrepp.businesswire

Startup-bolaget från Palo Alto, medgrundat av 2024 års nobelpristagare David Baker och AI-forskaren Eric Xing, positionerar AIDO Cell som ett steg vidare från verktyg som Google DeepMinds Alphabet Inc. ↘ 0.05% AlphaFold, som förutsäger strukturen hos enskilda proteiner. AIDO Cell syftar till att modellera hur det molekylära maskineriet i en hel cell beter sig som ett integrerat system.statnews

"Med AlphaFold förutsäger du strukturen hos ett hus eller lär dig om en person i den staden, medan du med AIDO Cell på sätt och vis förutsäger hur hela staden fungerar," sa Baker till STAT News.statnews

Hur det fungerar

AIDO Cell är byggt på en arkitektur som gör den både flerskalig och tillståndsberoende. En forskare kan påverka cellen på vilken nivå som helst, till exempel genom att slå ut en gen, och observera hur effekterna fortplantar sig från genreglering via proteinbeteende till cellen som helhet. Eftersom systemet minns tidigare ingrepp kan sekvenser av förändringar bygga på varandra istället för att behandlas som isolerade förutsägelser.businesswire

Ett medföljande perspektiv i Nature Medicine av medgrundarna Eric Xing, Eran Segal och Le Song beskriver en metod i tre steg: att bygga grundmodeller för enskilda biologiska modaliteter, koppla samman dessa modeller över olika skalor och sedan samköra hela nätverket till ett sammanhängande system.lifespan

Tidiga resultat och begränsningar

I en tidig demonstration använde GenBio AIDO Cell för att modellera effekterna av imatinib på leukemiceller och fann att systemet återskapade läkemedlets kända verkningsmekanism över flera nivåer av cellbiologi.businesswire

Systemet stöder för närvarande två allmänt använda odödliggjorda mänskliga cellinjer, K562, härledd från en patient med kronisk myeloisk leukemi, och HepG2, från en levertumör, med ytterligare celltyper under utveckling. GenBio beskriver denna utgåva som "en förhandsvisning, en tidig men funktionell demonstration" och planerar att släppa mer avancerade versioner senare i år och nästa år.businesswire

Implikationer för läkemedelsutveckling

Företaget ramar in AIDO Cell som en potentiell virtuell testarena för farmaceutisk forskning, där endast ungefär en av 10 000 substanser som går in i läkemedelsutvecklingsprocessen till slut når kliniken. "Ett system som AIDO Cell gör det möjligt för företag att snabbt och exakt utvärdera flera läkemedelskandidater, vilket leder till bättre, säkrare och mer effektiva behandlingar år tidigare än vad som är möjligt idag," sa medgrundaren och CSO Ziv Bar-Joseph, tidigare chef för AI på Sanofi ↗ 1.26%.businesswire

GenBio förbereder lanseringen av ett program för tidig tillgång för akademiska samarbetspartners inom akademi, bioteknik och läkemedelsindustri.lifespan+1